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Festival des Arts Numériques Libres

MediPy : Une plateforme de développement logiciel pour la neuroimage

Intervenant(s) : Julien Lamy

  • Langue : Français
  • Niveau : Confirmé
  • Type d'événement : Conférence
  • Date : Mardi 12 juillet 2011
  • Horaire : 15h20
  • Durée : 40 minutes

Lieu : Bâtiment Droit - Eisenmann (amphi 1)

Résumé

Au fur et à mesure, les images neurologiques deviennent de plus en plus complexes : en partant d’images radiographiques 2D, elles ont ensuite inclus des images 3D (CT-Scan ou IRM), des séries temporelles de données 3D (e.g. IRMf), et, plus récemment, des données non-scalaires, comme l’imagerie du tenseur de diffusion (DTI). Les algorithmes de traitement d’image ont suivi une évolution similaire, et les médecins comme les chercheurs ont besoin d’outils flexibles pour visualiser ces images et développer de nouveaux algorithmes. Pour répondre à ces besoins, nous avons développé MediPy, une plateforme libre de visualisation et de traitement d’images neurologiques. La partie visualisation permet les représentation sous forme d’image ou de surface de données 2D ou 3D, de séries temporelles et d’images de tenseur. La partie traitement donne aux développeurs des outils pour implémenter leurs algorithmes en Python ou en C++, avec une intégration facilitée dans d’autres bibliothèques (e.g. Numpy, ITK, VTK ou FSL). La plateforme contient une application principale pour la mise au point rapide de chaînes de traitement, et son architecture modulaire permet aux développeurs de créer facilement des applications plus spécialisées. Le code de cette plateforme est distribué sous licence CeCILL-B.

Biographie

Julien Lamy est ingénieur de recherche à l’Université de Strasbourg. Depuis 2005, il participe au développement de logiciels de traitement d’images médicales, notamment au sein de l’Ircad ou du NIH.

Documents joints

Document (PDF - 2.3 Mo)